產業界抱怨環保署資源回收基金收費太高，要求交由民間團體負責處理。環保署解釋，相關收費標準是由產業界、回收業與學者專家共同組成的委員會制訂，與國外標準比並未過高。至於產業界要求成立監督委員會確保資金流向，環保署承諾會與業者討論。

環保署回收基金會執行秘書林建輝說明，資源回收基金已經運作10年，目前約有8、90億元餘額，其中50億屬於信託基金，主要用途是補助回收業者。另外30幾億是非營業基金，用於稽核、認證、追緝漏繳、補助地方回收進行回收業務等。

林建輝指出，產業界抱怨資源回收基金收費太高，導致基金餘額暴增，並以此為由，要求降低收費標準，甚至主張免繳，以現有資金餘額運作，應已足夠。

不過，現行收費標準因為要保留「餘裕量」、避免業者突然倒閉、繳不出回收費，而預作準備，因此收費感覺會比較高，但是與各國收費標準比，其實並不會過高。

對於資源回收基金會購買大樓辦公室被批評是浪費錢、錢用不完，林建輝亦澄清，購買原力霸百貨一層約700坪的辦公室，是立院認為基金會與其長期繳交租金，不如買下租用的辦公室，比較划算，該計畫亦送環保署、行政院與立院審核，絕無故意浪費。

此外，針對產業界要求組成監督小組，確保回收基金每一分錢都花在刀口上，林建輝說，目前回收基金管理委員會已經納入產業界代表，但如果產業界認為這樣還不放心，環保署願意與產業界討論。

此外，為回應產業界需求，環保署亦著手修改廢棄物清理法，開放業者委外處理廢棄物回收，只是，業者必須先支付保證金，如果未達廢棄物回收量標準或違約，保證金將被沒收。