根據美國軍事上訴法院提供的資料，前總統陳水扁並沒有「控告」美國總統歐巴馬，而是「祈求」（pray）美國法院下令美國的軍政府指示馬英九總統立即放扁，並撤銷對扁的無期徒刑判決。

位在華府的美國軍事上訴法院已在周二宣布，對陳水扁所提的案子沒有管轄權，故不予受理。根據法院在九日提供的訴狀，陳水扁表示，依據《舊金山和約》，美國在台灣行使軍事占領，迄今未變，所以他的八年總統任內，他不但是三軍統帥，也是美國軍政府的代理人，是實際的台灣民政長官。

陳水扁指出，他在任內經常接受美國在台協會主席的指示，且直到今天，軍政府依然活躍。中華民國總統有許多職責，但有關台灣之事，美國軍政府是「至高無上」的。他表示，擔任總統期間，他知悉了軍政府存在的事實，他也接受軍政府的命令。這個軍政府是台灣的最高權力機構，唯有到了危急關頭，他才會證實軍政府的存在，而現在就是這樣的時刻。他面臨政治迫害，所以向法院及全世界披露軍政府，並要求軍政府出面保護他。

他在請願訴狀中提出數項要求，包括法院應命令涉台之美國軍政府承認他是軍政府在台灣的代理人；法院應下令美國軍政府指示「現任的台灣實際民政長官」中止對他的訴究，撤銷無期徒刑之判決，並恢復他的人權及公民權利。

他說，依據美國判例，占領地的民政長官不受當地法院管轄，所以中華民國無權審訊他。他又說，美國是主要占領國，中華民國是次要占領國；他代表的是主要占領國，依判例不受次要占領國的法院侵犯，所以美國軍政府應該保護他。他說，唯有適當組成的軍事委員會才有權審訊他。

他在訴狀中稱馬英九是現任實際民政長官、中華民國流亡政府總統。他說，台灣地位未定。他的請願不是尋求解決台灣主權問題，只是尋求美國承認他、保護他。

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