立法院大動作抓「政府肥貓」，卻引來監察院調查並要求改進，進而引爆兩院對槓。根據監察院內部會議紀錄，監院最初的調查對象，還包括退輔會，該案要求也要查退輔會是否「涉有怠忽職守」。不過，監委陳健民的調查報告卻只查立院、不見對退輔會有任何動作，氣得立院要反告到監察院長王建煊那兒，要監察院好好查查自己的監委是否「吃案」。

為抓肥貓，立院預算中心兩度針對泛公股事業列出名單，引來榮眷基金會秘書長陳炯伯不服，認為立院指稱他的職位是「酬庸」得來，有毀損名譽之嫌，因而一狀告上監院。結果，監院調查認定立院「確有可議之處」，並要求預算中心「從善如流」。

兩院為了「肥貓」槓上，立法院批評，監察院是否可調查立法院，在憲政上頗有爭議，而監院只查立院預算中心，沒有釐清退輔會是否違法失職，更涉及「吃案」之嫌。立院預算中心還打算上監察院「陳情」，原希望由同為國防委員會的監委黃煌雄查陳健民，同時還要告到王建煊那兒，讓監察院長好好查一查監委是否失職。

對於兩院爭議，監院出面緩頰說，到底退輔會有無行政疏失，可能是監委調查後發現並無不妥，結果當然不會「無中生有」，希望外界別誤解。另有監委私下表示，監院辦案最好符合「比例原則」，一位退役軍人質疑名譽受損是否有必要動用監院力量，確實有待討論。

引燃兩院戰火的監委陳健民強調，當初會打電話給預算中心要求相關人員說明，是基於尊重，為了本案，他還特地拜訪立法院長王金平，「當時王院長也問立院祕書長，要是立院公務員違法失職，誰來查，當然是監察院啊！」

陳健民說，「我也做過立委，立院調查報告要是寫得不好，不是害立委嗎？」他認為，立院也不該蔑視監察權。