台灣從5月20日出現第一起境外移入的H1N1確診病例後，疫情逐漸升溫；經過4個多月的宣導，台灣疫情已漸趨平緩。依行政院衛生署疾病管制局17日公布的「流感疫情監測每日摘要」，截至16日下午5點，台灣H1N1的確診病例為372例，其中326例已經出院，22例住院治療中，24例死亡病例，死亡率不到2%（每百萬人口死亡率）。

住院治療病例中，10月13日有一名出生24天女嬰，是目前台灣最年輕住院病例。截至14日下午4點為止，台灣停課學校已達284所、共462個班級。

大陸的H1N1疫情目前還不算太嚴重。根據大陸衛生部通報，10月14日到10月16日新增1636例確診病例，其中3例為境外移入，1633例為境內感染；截至16日為止，31個省市自治區總計有26348例確診病例，治癒22746例，其中，重症累計23例，已治癒10例，但也有2例死亡病例，分別由西藏和青海衛生部門通報。