美國牛肉風波也成為澎湖縣選舉話題，民進黨澎湖縣長參選人蔡見興緊咬國民黨候選人王乾發不放，要求簽立公投連署；甚至連日走上街頭完成三百多份連署書來響應。

民進黨大力動員呼籲重啟美國牛肉進口談判公投，澎湖民進黨縣黨部也炒作這話題炒熱年底地方三合一選舉，要求國民黨澎湖縣參選人公開表態。

民進黨澎湖縣黨部主委陳慧玲，帶領縣長參選人蔡見興、議員參選人楊曜、黃春燕、馬公市長參選人許麗音等人，一起走上街頭、走進菜市場，頻頻向選民們說明推動公投的意義。

蔡見興強調，馬政府沒有將台美協議書送交立法院備查，毫不尊重醫衛專業與全民的消費權益，咨意公告擴大開放美國牛產品，這樣的政府專橫、顢頇、更無理。

楊曜指出，政府罔顧民眾的身體健康，檢驗能力不足，埋下狂牛症入侵隱憂；解決當下問題只有重啟談判，或直接修法禁止美國牛進口，這才是正本清源辦法。

現任澎湖縣長王乾發回擊表示，中央公告後第一時間澎湖縣政府已擬定各項務實作法，衛生局除全面清查縣內所有肉品市場，同時與所有肉販達成共識，絕對不可進口美國牛產品。

另外，衛生局也設立了網站，將不定時公布縣內肉商清查結果，縣府一定全力把關，讓縣民吃得安心。