「兩岸一甲子」研討會涉及兩岸政治議題，引起各方重視。兩岸關係爭議的基本歧見，不只跟主權領土有關，更關係到基本的制度與社會發展差異，這早已非指經濟上的資本主義與社會主義之分，而是「民主自由多元」與「威權專政一元」的差異，若北京一再以「主權」角度處理兩岸分歧，卻無視於兩岸對民主制度的概念與實踐皆不相同，這恐怕才是兩岸當下難以邁向政治對話的真正障礙。

縱使兩岸同屬一國，習慣獨享權力的中共，是否有足夠的自信心，接受來自其他政黨的挑戰，願意在同樣的法治競賽規則下從事政治競爭，甚至有機會可能失去執政權嗎？這些都是中共領導人必須誠實回答台灣民眾的問題。大多數台灣民眾期望於北京中共領導人的，不是只有「和平統一」，而是希望看到大陸政治與社會出現根本性的變化，而這個改革，希望別再花上一甲子。