台電核廢料進駐澎湖東吉嶼議題引起討論，適逢年底縣長選舉，又成大家討論焦點，無獨有偶藍軍王乾發、綠軍蔡見興有志一同都表反對。

爭取蟬連的現任縣長王乾發很訝異，直指前行政院長劉兆玄視察澎湖接獲陳情後，台電隨即透露公投作業將喊停，如今怎麼又被炒作？他強調，澎湖縣政府立場始終如一，東吉嶼已劃定為自然保留區，依法不得開發，絕不容破壞，也拒辦公投。

民進黨縣長候選人蔡見興也明白指出，堅決反對核廢料進入澎湖。他說，澎湖這個美麗島嶼是國際觀光島，擁有獨特人文資產與自然景觀，每個澎湖人都應全力愛護，民進黨一定號召拒辦公投，抵制台電。

台電回應，外傳核廢料澎湖公投喊停未經證實，更何況經濟部建議候選場址，也不會因為政治考量就作罷，相關作業流程有一定的遊戲規則，這些全需要專家學者及有關單位審慎評估。