新竹縣政府結合交通大學規劃的「台灣知識經濟旗艦園區」國土開發案，歷經8年始獲行政院通過，隨著新竹生醫園區動土、招商，開發計畫已正式啟動。

交大新校區推動小組召集人林健正教授表示，台灣知識經濟旗艦園區結合既有竹科的產業優勢，對促進台灣產業升級與轉型有正面助益。

林健正教授指出，民國89年交通大學與新竹縣政府簽訂「璞玉計畫合作協議書」，以新訂都市計畫及區段徵收方式開發。

新竹縣政府無償撥供交通大學竹北校區用地，交大則協助規劃作業。民國93年因該計畫毗鄰高鐵車站及新竹生物醫學園區，可連結構成科學城軸帶，命名為「台灣知識經濟旗艦園區」，核定內容包括產業專區、交大研究校區及國際示範村。

對於台灣知識經濟旗艦園區未來的發展方向，林健正以學界研究角度分析，目前高鐵新竹站區開發進度仍待大力推動，如何強化毗鄰地區之就業機會、產業植根及住商活動需求，是當前最重要的課題。

而新竹站區定位為「生醫科技城」，建議規劃方向為扮演輔助科學園區、生醫園區生活需求為主，以「商務後勤」為導向，提供辦公設施，配置適量百貨休閒設施。