相對於大陸方面，行政院經濟部今年公布的整體發展願景中，同樣提出7項施政目標：帶動產業高值化並發展新興產業；優化傳統產業及中小企業發展環境，塑造優質即無障礙之投資經營環境；建設台灣成為全球創新中心。

以及架構全球連結之經貿網絡；確保質優穩定之水源及砂石供應；追求永續能源發展與能源供應安全。

在帶動產業高值化並發展新興產業方面，主要著重於新興服務業發展，促進電子商務市場等。政府將投入2.06兆元推動新興服務業發展，並投入3646億元擴大電子商務B2C及C2C市場規模。

政府也鼓勵傳統產業及中小企業運用政府資源投入創新研發，預計帶動中小企業投入創新研發衍生產值達46億元；加速升級轉型，提高中小企業競爭力；培育新創企業達225家。

為架構與全球連結的經貿網絡，政府希望成就11次雙邊經貿諮詢會議，以及在台舉辦8次國際會議；積極參與WTO及其他國際經貿組織；與特定貿易夥伴洽簽自由貿易協定；推動產業拓展海外市場，提升國際競爭力；善用貿易救濟制度，擴建貿易救濟防火牆等。

在發展綠色能源方面，經濟部98年度目標，設定產業溫室氣體減量45萬公噸、推動再生能源320萬瓦千。最後，為塑造優質以及無障礙的投資經營環境，政府加強擴大國內外招商吸引外商來台投資，鼓勵及協助台商回台投資。