目前市场上的定序平台仍以第二代定序平台(NGS)为主流,但 NGS在疾病相关基因变异的侦测及全基因体组装上仍有不足之处。有鑑于此,英华达与荣文生医在三年前即启动建构Nanopore第三代定序的专案计画,着手定序技术的建立与数据分析软硬体的建置。
基因定序在医学、食品、农业、畜牧、养殖等产业都有广泛的应用性。经过三年耕耘有成,目前荣文生医已将Nanopore最新且独有之定序技术adaptive sequencing整併至定序流程中,可以让使用者无须经过DNA富集(enrichment)等样本前处理程序,省去自行设计试剂的步骤,即可于定序过程中以软体即时分析判读欲定序之基因标的或染色体序列组合,大幅提升第三代定序之应用,为本服务平台最大的亮点。
英华达与荣文生医共同表示,以Nanopore定序人类与微生物全基因体为例,我们已累积数百例的定序与各种分析经验,并且在英华达顶尖软体研发团队的全力协助下,导入AI技术提升各软体之分析品质,组装出之基因体准确率可达99.999%,获得学研单位及医学中心的肯定。
继英华达与荣文生医共同开发之「IronMag循环肿瘤细胞自动化检测系统」获得国家新创奖肯定后,未来该系统将与此第三代定序技术结合,循环肿瘤细胞(CTC)之临床应用除了观察治疗前后之CTC数值变化以判断治疗成效外,尚可利用分离出来之CTC做基因定序,单次定序可同时分析700多种癌症相关之基因突变资讯,可在用药指引上,协助医师择定更精准且有效的治疗方法。
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