民眾党主席柯文哲二次开庭大逆转，从无保请回变成羁押禁见，承审法官吕政烨争议也遭起底，除了民进党前主席施明德曾控他自称「绿色法官」外，更在11年前因审案严重违反程序规定，曾遭监察院弹劾。
2013年，监察院发布新闻稿，指出吕政烨担任台北地院刑事审查庭法官期间，审理案件严重违反办案程序规定以及法官伦理规范，侵害诉讼人权益，损及司法信誉，事证明确情节重大，因此通过弹劾案，减少月俸20%，为期1年。
新闻稿指出，吕政烨违反办案程序包括：
1.酌留被告准备诉讼法定犹豫期间
2.漠视刑事诉讼法传唤被告应用传票规定
3剥夺被害人到庭陈述意见机会
4片面向被告表达否定告诉人请求损害赔偿的偏颇立场
5判决书制作粗率等违失，侵害被告及告诉人的诉讼权益
当时监委林鉅锒指出，吕政烨8件涉有违失案件中，6件违反刑事诉讼法，甚至有的连传票都没有发，另名监委李復甸也痛批吕政烨违反法官中立客观原则，竟为求结案之速，严重违反相关办案程序规定，影响司法信誉与人民对审判品质的信赖。
但也有业内人士认为吕政烨具有十足正义感，思考灵活应变快速，更曾在酒驾案判决中，罕见没收犯嫌车辆，「风格较为强势，只看证据不问立场还算公正」。
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