黃碧端表示，由於隔日立法院繼續進行文建會預算處理，她無法在如此情況下依然赴院與會，就算與會也無助於預算順利審查，所以她決定於廿八日向立院請假。一般而言，年度預算審查幾乎無請假空間，黃碧端只得以請辭獲准為由向立院請假。而吳敦義在同意處理請辭案時，與她曾有「對外不宣」的默契，因事非得已才打破此一默契。
文建會主委黃碧端來函表示，關於自己請辭一事，廿七日她致電行政院長吳敦義，表達辭意，並向院長報告將在次日開始請假。起因是前一日立法院教育文化委員會的預算審查中，突有立委於質詢時公開朗讀她與友人的通訊。她認為在議壇上，官員的人權包含通訊隱私，理應得到保護和尊重，作為知識分子和文化官員，她對此事自難以認同。
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