由於工程浩大，細節繁多，經過近兩年的多次會議討論，終於敲定最後書單。第一階段「東亞一百冊」以人文學術類書籍為限，預計下個階段擴及文學，展開「東亞一百部小說」計畫。
林載爵表示，這份書單象徵東亞共享的精神資產，打破過去東亞各國對立隔閡、知識分子之間互不瞭解的情況，同時反映出東亞在這一個多世紀以來，如何接納、批判與回應西方現代性的衝擊，反思各自的文化。
「東亞一百冊」計畫意義重大，同時也困難繁複，需考慮各國翻譯、流傳的價值，因此太過艱深的書籍必須放棄。屆時出版的每一本書，也會附加該著作的學術意義、作者採訪或評傳等導讀內容，以提出一份掌握廿世紀後半期東亞思想方向的文明地圖。
「東亞一百冊」的翻譯計畫將由各國自費出版，韓國、中國都有官方大力支持，台灣可能由民間發起、向官方爭取經費。
目前，僅規畫翻譯中、日、韓三國語言，但美國耶魯大學已表達高度興趣，因此未來也有機會推出英譯版本，讓東亞文化跨足向世界發聲。
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