政府高層表示，馬總統在齋藤正樹即將離台時接見，也象徵台灣地位未定論事件落幕，政府將此事視為危機事件，謹慎低調進行危機處理，如今此事件終告落幕。
馬英九昨日在總統府接見齋藤正樹，肯定齋藤一年五個月駐台表現，包括簽定打工度假協定、松山與羽田機場對飛等多項台日交流的成績，「過去一年是台日關係成長最快的階段」。
馬英九也宣布，台日雙方於十一日簽訂松山－羽田機場包機協定，預定明年十月，就可進行每天四班包機互飛，實現他在競選時所提出的重要政見。未來政府將推動更多包含民間在內的台日對話窗口。
齋藤則感謝馬總統接見，他說，日本每年都會就這一年來，針對文化、經濟等社會現象，選擇一個漢字做為代表，今年選出的漢字是「新」字，期盼新的一年，在新的駐台代表於明年一月到任後，開展更新的台日關係；他個人也願意繼續關注並協助台日關係的發展。
齋藤拜會馬總統後，國安會秘書長蘇起於圓山飯店設宴為齋藤餞行，齋藤十六日將作東舉日本天皇生日酒會，我政府最後出席層級還未確定，但國安會諮詢委員李嘉進確定與會。
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