《艋舺》票房紅不讓，盜版猖獗下，使得票房損失五至六千萬元之譜，導演鈕承澤更稱，盜版已影響《艋舺》票房新台幣八千萬元，登上國片盜版第一名。王美花指出，具體查獲的實體光碟片算事小，最嚴重的是網路侵權下載，尤其不少是大陸、香港或馬來西亞的網站涉及盜版交易，台灣很難管制海外網站侵權。
財產局表示，ＥＣＦＡ已將智財權列為主要討論範圍之一，但礙於ＥＣＦＡ以兩岸經貿議題為主，智財權無法仔細詳列，只能「框架式」的列入大方向議題。為加強兩岸智慧財產權保護，智慧財產局目前已著手擬定「兩岸智財權協議」，詳列後會納入第五次江陳會討論範圍，預計今年六月展開。
王美花表示，一旦簽訂協議，只要發現對岸有網站涉及盜版交易，就能立刻通知對岸相關單位，將網站封鎖。
同時，《艋舺》盜版較為特殊的地方，還有母片外流的盜版途徑。《艋舺》盜版已出現號稱像電影般的清晰版本，疑似是工作人員在電影未開播前，就已流出母片。對此，智慧財產局已對片商宣導力行母片辨識碼的機制，雖然成本較高，但較能有效管理母片。
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