王美玉指出，以這屆監院彈劾案件來說，水上警察考試洩密案和副總統吳敦義隨扈兒子李文億駕車肇逃案，都被公懲會決定停止審議。她指出，公懲會理由是援引公務員懲戒法，主張這些案件司法還在審理中，因此停止審議，但如前營建署長葉世文收賄案、前消防署長黃季敏圖利廠商案，公懲會都在司法審理中就作出懲處決定，「請問公懲會標準是什麼？」
王美玉也指出，公懲會的解釋是立法院已經修改公懲法，新的公懲法規定不停止審理為原則，停止審理則有但書，當公懲會合議庭認為有必要時，可以在一審刑事判決前，停止審理程序。換言之就是司法部分只要一審判決出爐，公懲會就不能停止審理。但王美玉指出，此法目前還沒上路，實施日期由司法院決定。
王美玉認為，刑事責任和行政責任的追究可以同時進行，監察院和公懲會追究的是行政責任非刑事責任，公懲會沒有一致標準地停止審理，「這樣的制度設計是錯誤的，等於剝奪監察院追究違法失職人員的權力」。
此外，王也指出，過去曾有立委質疑監委彈劾一案要價2000萬元，她認為，若是按照這種計算模式，「那也要加上公懲會委員的薪水，我看一案不止2000萬元，可能要3000萬！」
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