启碁积极实践低碳转型，优化生产流程和减废方式，避免废弃物因焚烧或掩埋致环境损害，提高废弃物转化率、减少资源浪费和废弃物处置成本，同时以ISO 14001管理废弃物，透过环境数据平台追踪、分析各制程或产源废弃物的组成比例，检视组织内资源循环的改善空间。2023年资源回收率达87％、效益超过新台币5,300万元，展现资源运用成果，为使绿色产品更具循环经济价值，以UL2799废弃物零填埋认证分析全据点的废弃资源产生流程，藉全厂访谈鑑别越南厂的废弃物流向，寻求改善机会，并对内加强教育训练，落实废弃物分类、减废、再利用，提高回收效益。此外，启碁长期关注生态保护、节能减废、绿色生产，并将这些价值融入建厂规画，评估生态绿化量、基地保水性、减碳与减废程度等，建造消耗最少地球资源、制造最少废弃物，具生态、节能、健康特性的建筑物。
南科厂是启碁第一个绿建筑厂房，如今越南二期厂房获美国绿色建筑协会（USGBC）授予LEED黄金级认证，LEED以环境多样性与绿色交通、空间永续性、水资源运用效率、能源与大气管理等为评比构面，启碁设置高效用水设备、智慧水表、再利用系统，执行太阳能自发自用与扩建专案，利用厂区剩余空间增设太阳能发电，使越南厂区整体太阳能板总建置容量达5,445kWP，年度可达约500万度自用发电量，绿电使用比例增至8％，又以HVAC系统、优化建筑外壳等措施提高能源使用率，在水资源、能源管理方面获得近乎满分的肯定。
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