今年5月发生在南方四岛国家公园游客违法捕捞渔获，因游客乘坐游艇为国立澎湖科技大学所有的「海洋2号」，澎湖县调查站疑有弊端，报请澎湖地检署吴巡龙检察官指挥侦办，由澎湖县调查站、南部地区机动工作站组成专案小组，经数月之调查搜证分析，认时机成熟，向法院声请搜索票获准，于17日上午执行搜索，共计搜索6个地点，另带同被告3人、证人4人进行讯问。
经检察官侦讯及调查证据后，认为澎科大海洋游憩系前系主任陈正国教授涉犯刑法偽造文书、诈欺取财、背信及政府採购法等犯嫌重大，且有勾串、灭证之虞，向法院声请羁押禁见获准，另2名被告即澎科大教授胡俊杰、业者郭香瑜则谕令请回。
今年5月7日发生6名潜水客在东吉附近海域漂流，被岸巡补给船救起的意外，经查是「亚果PIDC潜水中心」的教练与客人，负责载送游艇则是澎科大「海洋2号」，由于救起6人的装备中，发现网袋有龙虾、麵包蟹，遭海洋保育志工检举违法捕捞，已明显违反渔业法相关规定。
澎湖地检署重申，各公家机关有採购需求时，务必遵守相关法规，勿便宜行事，获取不法利益，若有违法情事，检方将全力侦办，维护公务体系之廉洁。
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