蓝白合进度陷入泥沼，中广董事长赵少康18日直言，民眾党似乎想打赢者全拿的淘汰赛，他说，民眾党总统参选人柯文哲没宣示过「反台独」，应要清楚表态，不能蒙混过去，绿的票也要、蓝的票也骗。对此，前立委蔡正元19日就表示，「我当然不认为柯文哲是支持台独，除了联合政府怎么组织、运作、基本纲领政策之外，他这个问题也应该在组联合政府的时候，大家谈清楚」，引发讨论。
蔡正元19日在政论节目《庶民大头家》中表示，「柯文哲当然要把他的立场说清楚，为什么要蓝白合？蓝白合就是合组联合政府才叫蓝白合，你不合组联合政府，你蓝白合有什么意义？为什么要合组联合政府？就是要下架民进党，难道你民进党不下架，联合政府能上台吗？这是基本逻辑」。
蔡正元更说，「那你要组联合政府，大家就要把自己最忌讳的事情拿出来谈，你总不能组了联合政府之后，你主张台独，我不主张台独，那这个联合政府怎么搞？这是一个核心的基本问题，我当然不认为柯文哲是支持台独，除了联合政府怎么组织、运作、基本纲领政策之外，他这个问题也应该在组联合政府的时候，大家谈清楚，谈好之后要组联合政府，我们再来谈游戏规则」。
蔡正元更说，「游戏规则就是说，这个联合政府总该有一个人选总统、一个人选副总统，该怎么弄？联合政府在政治学上只有一个定义，就是党对党的联合」。蔡正元最后坦言，「我是最早支持蓝白合、联合政府的，还公开主张认为柯侯配才能当选，我是看完民调才来说的」。
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