疾管署公布明年度防疫预算845亿元，远比今年度187亿元多出658亿元，前副总统吕秀莲质疑「背后有玄机」，国民党也怀疑是为了2024年大选绑桩使用。行政院长苏贞昌昨在立法院解释，明年没编特别预算，才将845亿元编在年度预算内，国民党不该指鹿为马、扭曲事实；国民党立委洪孟楷回呛，这不是指鹿为马，反倒是苏贞昌「狸猫换太子」，炮轰苏贞昌才不该偷换概念，防疫预算须一笔笔检视。
疾管署昨表示，近年的防疫经费主要来源为8400亿元防疫特别预算，而特别预算将于今年底用罄，相关防疫需求必须回归编列一般公务预算来支应；且明年疫情无法预测，疫苗、药物、治疗跟防疫物资等均须做适当准备，因此于明年编列COVID-19防治经费845亿元。
洪孟楷指出，8400亿元特别预算是因为特别状况才编列因应，这是过去不分朝野，共同支持行政部门。然而，后疫情时代即将来临，10月13日就要开放国门，但明年仍要编列845亿元防疫预算，难道是预期未来的疫情仍然会像去年、今年一样严重吗？845亿元这笔预算当然有可议之处，必须一笔一笔地来检视。
国民党台北市长参选人蒋万安昨接受广播专访，提及中央流行疫情指挥中心存废时表示，值得注意的是，媒体预算为什么花费近8亿，根据《传染病防治法》，防疫期间如果成立指挥中心，政府可以徵用相关频道做政令宣导，花了近8亿大家就会怀疑要用来做什么，是不是要给亲绿媒体、侧翼或网军？
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