荷兰的殖民者，最早建立的第一个据点是热兰遮城，汉人称为台湾城（或大员城，都是闽南语的音译）。台湾城位于大鲲身的中心位置，扼守大员水道，三面环水，易守难攻。随后，又在台湾城以东的陆地建了普罗民遮城，汉人称为赤崁城。赤崁城与内陆交通方便，是人员、物资的集散地，包括建立在孤岛上的台湾城的物资也需要由赤崁城提供。荷兰人修建赤崁城的目的主要是从商业价值考虑，而台湾城则是军事需要。
沙洲不是修建港口的理想场所，因为附近海水浅，而且随着时间，海岸线会往外推移，使原本的港口变成内陆城镇。理想的港口是建立在岩石或火山岛上，稳固而水深，例如鸡笼港。但考虑到与中国大陆的距离，以及附近土地的耕种条件，在台湾岛西部还找不到一个比大员更好的地方。荷兰殖民者到这里建立据点，既有商业考虑，又有军事考量，而台江内海的存在恰好满足了这两个要求。
假设郑成功从中国大陆过来直攻台湾城，台湾城出于军事目的修建，城墙很坚固，城楼有炮台，附近的港口有军舰支援，最后的结果可能是陷入胶着战，不分胜负。而此时，赤崁城会源源不断地替台湾城提供物资，时间一长，远道而来的郑成功只能无功而返。所以，郑成功想拿下台湾城，最好先拿下防守薄弱的赤崁城，切断台湾城的物资来源，台湾城就陷于孤立无援的境地，投降是迟早的事。
想拿下赤崁城，就要进入台江内海。而进入台江内海的通道有两个，一个是位于大员岛和北线尾岛之间的大员水道，另一个是位于北线尾岛北端的鹿耳门水道。大员水道深，是主要通道，鹿耳门水道浅，只能走一些小船。荷兰人修建台湾城正是为了扼守大员水道，除了台湾城，水道两岸还修建了炮台。荷兰人原本于1627年在北线尾岛北端也修建了堡垒，后来发现没什么用，1656年堡垒坍塌后就废弃了，不再派人把守。一般武装帆船船体较大，吃水深，走大员水道成为唯一的选择。从经济上考量，精明的荷兰人觉得没必要再花钱守卫鹿耳门水道了。
但是，何斌发现其中的漏洞，每逢初一和十六，海水涨潮，鹿耳门水道可以通行大船。荷兰人把防守的重心都放在台湾城，而鹿耳门没有派兵防守，如果趁涨潮时，完全可以从这里进入台江内海。
1661年3月底，郑成功被暴风雨困在澎湖，心急如焚，正是想赶在4月初一这天到达鹿耳门，趁涨潮时从鹿耳门水道进入台江内海，如果错过，又要等半个月。为了不贻误战机，他当机立断，强行渡海。
3月30日，郑军冒着暴风雨，和风浪搏斗，终于在4月初一拂晓到达鹿耳门水道海外。
郑成功先换上小船，亲自登上北线尾岛察看地形，同时派出潜水精兵进入台江内海侦察。
中午，果然潮水大涨，郑军立即进入鹿耳门水道，然后兵分两路：一路进入台江内海，一路登陆北线尾岛。进入台江的舰队是主力，抢占北线尾岛既是为了控制鹿耳门水道，也是为了保障主力后方的安全。
荷兰人对郑军的到来并非一无所知，如前所述，他们以为郑成功必然会从大员水道进入，将火力全部集中在大员水道两岸，没想到郑成功出其不意，打了个措手不及。
进入台江内海的舰队兵分两路：一路往南，切断台湾城和赤崁城的联繫；一路往东，在禾寮港抢滩登陆。
附近的汉人和原住民听说国姓爷来收拾荷兰人，争先恐后地出来迎接，帮助郑军登陆。据荷兰方面的记载，大约有2万5千名壮劳参与协助。
在禾寮港登陆的郑军立即南下，目标是包围赤崁城。
【未完待续】
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